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Jacques VAN HELDEN


coordonnées


Jacques VAN HELDEN
tel +32-2-650.54.66, fax +32-2-650.54.25, jvanheld@bigre.ulb.ac.be
http://www.bigre.ulb.ac.be/~jvanheld/
Campus de la Plaine
CP263, boulevard du Triomphe, 1050 Bruxelles




unités de recherche


Bioinformatique des génomes et des réseaux (anciennement Service de conformation des macromolécules biologique et de bioinformatique) [Genome and Network Bioinformatics (previously: Service of Conformation of Biological Macromolecules and Bioinformatics)] (BiGRe)



projets


Analyse des séquences régulatrices [Analysis of regulatory sequences]
Développement d'approches bioinformatiques pour la prédiction d'éléments de régulation à partir de séquences génomiques (http://rsat.scmbb.ulb.ac.be/rsat/). [Development of bioinformatics approaches for the prediction of regulatory elements from genomic sequences (http://rsat.scmbb.ulb.ac.be/rsat/).]

Analyse des réseaux d'interactions moléculaires [Analysis of molecular interaction networks]
Développement et application de méthodes d'analyse des graphes pour interpréter les données à haut débit concernant les réseaux d'interactions moléculaires. Nous nous intéressons aux réseaux d'interactions protéines-protéines (données doubles hybrides, ou de spectrométrie de masse), aux réseaux de régulation (obtenus à partir de données de biopuces ou inférés à partir de signaux cis-régulateurs), interactions protéines-ADN (données de ChIP-chip), voies métaboliques et de transduction de signal. [Development and applicatin of graph analysis methods for the interpretation of high-throughput data concerning networks of molecular interactions. We are focused on protein-protein interaction networks (two-hybrid + mass spectrometry data), regulatory networks (obtained from microarray data or inferred from cis-regulatory signals), protein-DNA interactions (ChIP-chip data), metabolic pathways and signal transduction pathways. ]

Inférence des voies métaboliques [Inference of metabolic pathways]
Nous développons des méthodes permettant d'inférer des voies métaboliques par recherche de chemins dans les réseaux réactionnels. Ces méthodes sont appliquées pour inférer des voies métaboliques à partir de groupes fonctionnellement liés (groupes de co-expression, opérons, profils phylogénétiques, ...). Ces méthodes sont également appliquées à l'analyse des voies de transduction de signal. [We developed methods to infer metabolic pathways using path finding algorithms in a reaction network. These methods are applied to infer metabolic pathways from groups of functionally related genes (co-expressed, operons, phylogenetic profiles, ...). More recently, we extended these methods to aply them to signal transduction pathways. ]



disciplines et mots clés déclarés


Biologie Biologie moléculaire Biologie théorique Informatique générale

analyse de graphes analyse de séquences bioinformatique découverte de motifs métabolisme recherche de chemins régulation transcriptionnelle réseaux moléculaires topologie des réseaux