Téléchargement de logiciels RMN

1) Remarques préliminaires:

Les programmes disponibles ci-dessous ont été initialement conçus, programmés et testés en Linux et nous les utilisons essentiellement sur des plateformes Linux au sein de notre laboratoire. Cependant, les logiciels ont été également compilés pour window (98, 2000, XP) afin de les rendre accessibles pour le plus grand nombre. Les versions Linux et Macintosh OSX sont disponibles sur demande (ppirotte@ulb.ac.be).

Bien qu'ils aient été tous testés par nos soins, nous dégageons notre responsabilité de tout dommage, de quelque nature que ce soit, résultant directement ou indirectement de l'installation, de l'utilisation ou de l'impossibilité d'utiliser un ou plusieur des logiciels proposés. Sans accord écrit préalable, les logiciels sont uniquement destinés à un usage individuel et privé.
Dans l'éventualité où vous utilisiez ces programmes, nous serions heureux de recevoir vos commentaires et suggestions. N'hésitez pas à nous contacter par E-mail

*** IMPORTANT *** IMPORTANT *** IMPORTANT ***

Les programmes compilés par

nécessitent l'installation préalable d'une librairie. Celle-ci est identique pour tous les programme

. Elle ne doit être installée qu'une seule fois, quels que soient les programmes

compilés que vous souhaitez utiliser. Cette librairie est inutile si vous disposez des sources et du logiciel

(Linux et Macintosh).

Installation de la librairie:
1) télécharger le fichier contenant la librairie (lien ci-dessous),
2) décompresser (format zip),
3) double-cliquer sur "lvruntimeeng.msi"
4) suivre les instructions.

TELECHARGER la librairie nécessaire pour LabView (Windows 98, 2000, XP taille: 14,8 Mo)

2) Convertisseur de fichiers 2D TecMag exportés en format "txt":

Le format d'exportation ASCII des fichiers 2D

se prête difficilement à un traitement aisé des données par les logiciels ou Kaleïdagraph. Un programme de conversion a donc été réalisé. Il permet de conditionner les données de manière plus conviviale afin de les rendre directement exploitables. Le fichier généré portera l'extension "dat" afin d'être directement compatible avec l'importation des listes par le programme (voir ci-dessous). Si vous souhaitez utiliser Kaleïdagraph, il faudra changer l'extension "dat" par "txt". Programme rédigé en

TELECHARGER (taille: 193,2 ko)

Une fois traitées par le programme

(voir point précédent), les données seront affichées à l'aide de Kaleïdagraph ou de . Voici, par exemple, un notebook qui affiche un graphe en 3 dimensions ainsi que les courbes de niveau et la somme des spectres dans la seconde dimension. Ce notebook a été utilisé pour le traitement de données issues d'expériences de type CP-WISE (voir graphiques ci-dessous).

4) Programme de traitement des FIDs "échos solides" MARAN exportés en format "txt":

Ce programme permet de traiter des FID MARAN issus de manipulations "échos solides" et exportés en format "txt". Il recherche le maximum du module du FID et supprime les points qui précédent afin de ne retenir que la partie utile de l'écho. Il calcule ensuite le dwell et recrée l'axe x correct (l'axe X généré par le MARAN est systématiquement erroné, en raison d'un bug interne au spectromètre).

Il effectue ensuite la FT et permet de phaser en se basant sur l'affichage simultané (en temps réel) du FID et de la FFT. Le programme permet d'augmenter artificiellement la longueur du vecteur avant la FFT (zero filling). Ce procédé améliore la résolution de la FFT. La fréquence des protons est fixée arbitrairement à 20 MHz et celle des fluors à 18,9 MHz. Un exemple de fichier est fourni (test.txt). Programme rédigé en

TELECHARGER (taille: 491,0 ko)

5) Programme de lecture des fichiers TecMag (NTNMR) avec sauvegarde en Simpson:

Visualisation des fichiers tnt TecMag

Ce programme permet d'extraire les données et les paramètres d'acquisition des fichiers "tnt" de (fids et spectres) et de les sauver en format Simpson. Il est actuellement en cours de développement. La version compilée (disponible ci-dessous) ne permet pas de sauver les fichiers en format Simpson. Pour obtenir gratuitement la version complète, veuillez nous contacter (ppirotte@ulb.ac.be). Vos remarques et suggestions sont les bienvenues.

TELECHARGER la version compilée de démonstration (taille: 538,2 ko)

6) Simulateur de spectromètre RMN

Simulateur

Le simulateur a été conçu pour mettre en évidence l'effet des principaux paramètres d'acquisition sur le signal RMN. Par la suite, certains artefacts engendrés par les circuits électroniques ou par des conditions d'acquisition inadaptées ont étés implémentés. Au delà des équations mathématiques, le simple fait de voir en temps réel (en fait, bien plus vite que cela car nous ne sommes pas limités par les caractéristiques physiques; T1, T2, ...) ce qui se passe en agissant sur certains réglages, améliore la compréhension d'un processus expérimental parfois bien plus complexe qu'il n'y paraît... Mon souhait est que vous ayez autant de plaisir à l'utiliser que j'en ai eu à le concevoir. Programme rédigé en .

Téléchargement (programme et mode d'emploi)

7) Programme de lecture directe et d'extraction de données des fichiers MSL300 de Bruker:

Traitement fichers bruts MSL300

Ce programme permet d'extraire les données et les paramètres d'acquisition des fichiers MSL300 bruts de (fids et spectres). Son développement est actuellement arrêté. Je mets à la disposition de toute personne intéressée les sources .

TELECHARGER les sources

(taille: 491,9 ko)

8) Programme de lecture des fichiers 2D TecMag:

Traitement fichiers 2D TecMag
Données affichées par Display2D

LabPlot
Affichage des données (sauvées en format "Matriciel" par Display2D) avec le logiciel libre LabPlot

Les fichiers 2D générés lors de certaines expériences RMN peuvent être très volumineux (parfois plusieurs dizaines de Mo). Display2D permet d'ouvrir et d'afficher les fichiers 2D TecMag (exportés en format texte), d'effectuer des coupes dans les deux dimensions, de sélectionner une zone, de sauver les données sous différents formats (matriciel, jpg, txt) et de filtrer le bruit de fond (grass noise). La version compilée (disponible ci-dessous) ne permet pas de sauver les données. Pour obtenir gratuitement la version complète, veuillez nous contacter (ppirotte@ulb.ac.be). Vos remarques et suggestions sont les bienvenues. Programme rédigé en .

TELECHARGER la version compilée de démonstration (taille: 325,1 ko)

9) Programme de conversion des fichiers Bruker (DSX) vers le format TecMag (NTNMR):

Conversion DSX vers TNT

Ce programme permet d'ouvrir des fichiers 1D Bruker DSX (FID ou FFT) et de les sauver ensuite en format TecMag (NTNMR). Seules les données et les paramètres essentiels sont traduits. Le programme ne convertit pas le pulse program Bruker DSX en pulse program au format TecMag. Ce programme est toujours en phase de développement. Il est entièrement gratuit, vous le recevrez sur simple demande (ppirotte@ulb.ac.be). Programme rédigé en

DEMANDER le programme compilé (taille: 284,2 ko)