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Inférence des voies métaboliques [Inference of metabolic pathways]

Nous développons des méthodes permettant d'inférer des voies métaboliques par recherche de chemins dans les réseaux réactionnels. Ces méthodes sont appliquées pour inférer des voies métaboliques à partir de groupes fonctionnellement liés (groupes de co-expression, opérons, profils phylogénétiques, ...). Ces méthodes sont également appliquées à l'analyse des voies de transduction de signal. [We developed methods to infer metabolic pathways using path finding algorithms in a reaction network. These methods are applied to infer metabolic pathways from groups of functionally related genes (co-expressed, operons, phylogenetic profiles, ...). More recently, we extended these methods to aply them to signal transduction pathways. ]



responsable


Jacques VAN HELDEN


équipe


Karoline FAUST


disciplines et mots clés déclarés


Biologie

bioinformatique métabolisme recherche de chemins topologie des réseaux