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Dimitri GILIS


coordonnées


Ecole polytechnique de Bruxelles
Dimitri GILIS
tel 02 650 36 15, fax 02 650 35 75, Dimitri.Gilis@ulb.ac.be
Campus du Solbosch
CP165/61, avenue F.D. Roosevelt 50, 1050 Bruxelles



unités de recherche


Bioinformatique génomique et structurale [3BIO - Genomic and structural bioinformatics] (3BIO-BioInfo)



projets


Lien entre séquence, structure et stabilité des protéines [Protein sequence-structure-stability relationships]
Prédiction de la structure, la stabilité thermodynamique, la stabilité thermique et la solubilité des protéines à partir de leur séquence en acides aminés. Conception rationnelle de protéines modifiées. [Prediction of the structure, thermodynamic stability, thermal stability and solubility of proteins from their amino acid sequence, using statistical potentials. Rational design of modified proteins. ]

Conformations alternatives des protéines [Alternative conformations in proteins]
Etudes des caractéristiques de séquence et de structure des protéines formant des structures alternatives, par exemple dans le cas d'échanges de domaines 3D et des maladies conformationnelles. [Study of the sequence and structure characteristics of proteins that adopt alternative conformations, par example in the case of 3D domain swapping and conformational diseases.]

Etude des interactions non-covalentes dans les biomolécules [Study of non covalent interactions in biomolecules]
Etude des interactions de type cation-pi, amino-pi et pi-pi par analyse structurale et calculs de chimie quantique dans les protéines et à l'interface entre protéine et ADN ou entre protéine et ligands. [Structural analyses and quantum chemistry calculations of cation-pi, amino-pi, and pi-pi interactions in proteins and at the interface between protein and DNA or ligands.]

Interactions protéine-protéine, protéine-ADN et protéine-ligand [Protein-protein, protein-DNA and protein-ligand interactions]
Etude de complexes supramoléculaires et conception rationnelle de ligands via des analyses structurales, des approches de chimie quantique et logiciels et des techniques d'amarrage. Etude in silico de la migration de charges dans l'ADN. [Study of supramolecular complexes and rational ligand design via structural analyses, quantum chemistry approaches and docking techniques. In silico study of charge migration in DNA.]

Modélisation dynamique de l'expression des gènes [Dynamic modeling of gene expression]
Analyse de données issues de biopuces et construction de modèles dynamiques sous forme d'équations différentielles, mimant l'évolution temporelle de l'expression des gènes. [Analysis of microarray data and construction of dynamical models using differential equations, mimicking the temporal evolution of gene expression. ]

Origine de la vie: peptides prébiotiques [Origin of life: prebiotic peptides]
Recherche du lien manquant entre les acides aminés et les premières protéines à partir de données sur les protéines actuelles. [Search for the missing link between amino acids and the first proteins using data about present-day proteins.]



prix


Prix de la Société Royale de Chimie (mémoire, 1994)

Prix de la Société Royale de Chimie (mémoire, 1994)



disciplines et mots clés déclarés


Biophysique

analyse structurale chimie quantique conception rationnelle docking echanges de domaines 3d expression des gènes interaction cation-pi maladies conformationnelles migration de charges dans l'adn origine de la vie potentiels statistiques puces à adn