Transport des nutriments (N, P, Si) à l'interface continent-océan et mécanismes d'eutrophisation côtière. Application à l'Escaut et à la baie sud de la Mer du Nord (Projet PAI 2007-2011).
Développement de modèles d'orientation à la décision en matière de gestion de la qualité de l'eau et des écosystèmes aquatiques: couplage d'un modèle de bassin versant décrivant la qualité des eaux de l'Escaut en fonction des contraintes naturelles et anthropiques (modèle RIVERSTRAHLER) et les apports de nutriments à la mer avec un modèle d'écosystème marin (modèle MIRO)

Analyse et modélisation de l'eutrophisation côtière en Baie Sud de la mer du Nord dominée par des efflorescences de Phaeocystis
Etude et modélisation de la structure et du fonctionnement de l'écosystème côtier soumis à l'influence des activités humaines sur le bassin versant via l'apport de nutriments par les rivières. Définition de critères écologiques quantitatifs pour l'identification des zones eutrophisées à problèmes.

Rôle de l'océan antarctique (et de la glace de mer) dans les changements globaux : étude et modélisation des mécanismes physico-chimiques et biologiques de contrôle des échanges de CO2 à l'interface air/glace/mer
Etude et modélisation du réseau trophique antarctique et des flux de matière associés en fonction de la lumière et de la disponibilité en fer (modèle SWAMCO).

Etude et surveillance de la qualité microbiologique des eaux naturelles (continentales et marines), des eaux usées et de distribution
Analyse de l'activité, de la diversité et du rôle du compartiment bactérien dans le fonctionnement des systèmes aquatiques ; étude et modélisation du devenir des micro-organismes d'intérêt sanitaire dans l'environnement aquatique ; développement de techniques de détection des micro-organismes d'intérêt sanitaire.

Becquevort, S., ''Importance du Réseau Trophique Microbien dans l'Océan Antarctique; Rôle du protozooplancton'', Dir. Dr. C. Lancelot, GMMA, ULB, Bruxelles, 1999