Olivier DEBEIR

Traitement, Analyse de l'Image et Reconnaissance de formes. [Image Processing, Image Analysis, and Pattern Recognition.]
L'image numérique recèle une grande quantité d'informations corrélées et exploitables, permettant d'extraire des objets par segmentation. Cette segmentation des images nécessite d'extraire de celles-ci les attributs qui permettront, selon des spécifications précisées, de séparer les ''formes'' du ''fond''. Les résultats conduisent aussi bien à la compression, qu'au contrôle de qualité, la reconstitution 3D ou l'aide au diagnostic. A côté des méthodes classiques basées sur la notion de bord, les approches privilégiées sont basées sur la classification de pixels, supervisées ou non, ou sur la corrélation non linéaire à partir d'exemples. [A digital image contains numerous correlated informations which may be processed in order to extract objects by segmentation. Image segmentation needs to compute features to separate '' objects'' from the so-called background. This process leads to several applications, such as data compression, quality control, 3D reconstruction or computer-aided diagnosis. Besides the standard methods based on edge detection, other approaches using pixel classification and non-linear correlation are investigated.]

Suivi et analyse du comportement de cellules cancéreuses au sein de cultures in vitro [Dynamic behaviour analysis of in vitro cancer cells]
Un système d'acquisition d'images digitales associé à une étuve régulée permet d'observer des cultures monocouches (2D) et des gels (3D) pendant de longs laps de temps. Un traitement original de ces séquences d'images permet d'archiver et d'extraire une grande quantité de données. L'objectif est d'en extraire des informations pertinentes sur la durée de vie, la dynamique de croissance, de motilité et de colonisation de cellules soumises à différentes conditions expérimentales. [Acquisition systems connected with thermoregulated incubators make possible long-term observation of 2D and 3D in vitro cultures of cancer cells. Processing of microscopic image sequences allows storing and extraction of large data sets. This aims to take out relevant information on growth and death rates, division duration, motility and colonization rate from cells in different experimental conditions.]

Analyse d'images acquises par télédétection [Remote sensing image analysis]
La mise à jour automatique de données topographiques est une problématique actuelle et complexe. L'objectif général de ce projet est de capitaliser les connaissance des partenaires dans le développement d'un démonstrateur permettant aux producteurs de données topographiques d'actualiser plus efficacement leur base de données, mettant en oeuvre des techniques récentes de traitement d'images et d'analyse statistique. Les données seront issues d'images de télédétection et des données statistiques socio-économiques. Pour atteindre cet objectif général, deux grands axes sont distingués : -A une échelle régionale, l'objectif est d'analyser les bases de données topographiques de multiples sources comme les images satélitaires, les bases de données démographiques, économiques afin de prévoir la localisation des changements relatifs aux structures humaines (comme des maisons, routes, etc.). -A une échelle locale, de zones de changement seront détectées par la comparaison de bases existantes avec les données récentes. [Topographical data producers are currently confronted the need of a faster updating method. Although state-of-the-art techniques exists, no automated tool predicts and locates changes. The general objective of the project is to capitalize partners' knowledge in the development of a demonstrator to assist data producers in updating more efficiently their topographic database by using state-of-the-art image processing and statistical analysis techniques. Data will include remote sensing images, together with socio-economical data. To achieve this general objective, two main axes are distinguished: - At a regional scale, the objective is to analyze topographical databases from multiple sources such as satellite images, demographic database, or economic database in order to predict information about the localization of changes in man-made structures (such as houses, roads, etc.). -At a local scale, for areas of predicted changes the older databases will be compared with recent very high resolution images in order to detect and recognize differences (errors in the topographical database, building construction, road construction, etc).]

Analyse d'images et de données en anatomie pathologique [Image and data analysis in pathology]
Ce projet a pour objectif le développement de méthodes de standardisation, de calibration et d'extraction automatique de caractéristiques appliquées aux images de coloration immunohistochimique. La quantification d'immunomarquages via des techniques d'analyse d'images permet la caractérisation d'expression d'antigènes révélés par immunohistochimie (IHC) sur des coupes de tissus normaux ou pathologiques. Contrairement à d'autres techniques biochimiques, l'IHC préserve l'aspect morphologique du tissu analysé et permet une localisation précise des expressions, évitant les problèmes causés par l'hétérogénéité des tissus analysés. Il s'agit d'une approche prometteuse pour l'identification de biomarqueurs à des fins diagnostiques, pronostiques et/ou thérapeutiques. Ce projet est mené en étroite collaboration avec le service d'anatomie pathologique de l'hôpital Erasme (Pr. I. Salmon). [This project aims to develop standardization, calibration and automatic feature extraction methods from immunohistochemical images. The quantification of immunostaining by means of digital image analysis allows the characterization of protein expression revealed by immunohistochemistry on normal or pathological tissue slices. In contrast to other methods of evaluation of protein expression, this approach enables morphological controls and detailed tissue and cell localization to be carried out, avoiding the problems due to cell and tissue heterogeneity. This constitutes a promising approach for the identification of biomarkers usefull for diagnostic, prognostic and/or therapeutic purposes.This project is carried out in close collaboration with the Pathology Department of the Erasme Hospital (Pr. I. Salmon).]

Analyse de séquences vidéo [Video sequence analysis]
Le but de ce projet est de concevoir et développer un système d'analyse de scènes dynamiques en temps réel sur base de séquences acquises à l'aide d'une ou plusieurs caméras. L'application principale visée est l'analyse du trafic sur une autoroute. Il s'agit de déterminer les trajectoires spatio-temporelles des véhicules ainsi que leurs catégories ou classes (voiture, camion, etc.) et d'autres paramètres du trafic. [This project aims to develop a real time system of video sequence analysis using one or multiple camera(s). The main application focuses on motorway trafic analysis and aims to determine vehicle trajectories together with other parameters such as vehicle classes (car, truck, ...) and trafic features.]

Extraction de nouveaux descripteurs de marquages immunohistochimiques par analyse d'images [Extraction of new immunostain descriptors by means of image analysis]
Dévelopement d'outils d'analyse d'images pour l'extraction de nouveaux descripteurs dans le but de décrire la topologie des immunomarquages (organisation et distribution spatiale) ainsi que la colocalisation de plusieurs marquages réalisés sur des coupes sériées. [Development of image analysis tools for extracting new features characterizing immunostain topology (i.e. spatial distribution and organization) as well as immunostain colocalization on serial slides. ]