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Christine DECAESTECKER

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coordonnées

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Ecole polytechnique de Bruxelles |
| Christine DECAESTECKER |
 | tel 02 650 22 95, fax 02 650 22 98, cdecaes@ulb.ac.be |
 | Campus du Solbosch |
 | CP165/57, avenue F.D. Roosevelt 50, 1050 Bruxelles |

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unités de recherche

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projets

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Traitement, Analyse de l'Image et Reconnaissance de formes. [Image Processing, Image Analysis, and Pattern Recognition.]
L'image numérique recèle une grande quantité d'informations corrélées et exploitables, permettant d'extraire des objets par segmentation. Cette segmentation des images nécessite d'extraire de celles-ci les attributs qui permettront, selon des spécifications précisées, de séparer les ''formes'' du ''fond''. Les résultats conduisent aussi bien à la compression, qu'au contrôle de qualité, la reconstitution 3D ou l'aide au diagnostic. A côté des méthodes classiques basées sur la notion de bord, les approches privilégiées sont basées sur la classification de pixels, supervisées ou non, ou sur la corrélation non linéaire à partir d'exemples. [A digital image contains numerous correlated informations which may be processed in order to extract objects by segmentation. Image segmentation needs to compute features to separate '' objects'' from the so-called background. This process leads to several applications, such as data compression, quality control, 3D reconstruction or computer-aided diagnosis. Besides the standard methods based on edge detection, other approaches using pixel classification and non-linear correlation are investigated.]
Suivi et analyse du comportement de cellules cancéreuses au sein de cultures in vitro [Dynamic behaviour analysis of in vitro cancer cells]
Un système d'acquisition d'images digitales associé à une étuve régulée permet d'observer des cultures monocouches (2D) et des gels (3D) pendant de longs laps de temps. Un traitement original de ces séquences d'images permet d'archiver et d'extraire une grande quantité de données. L'objectif est d'en extraire des informations pertinentes sur la durée de vie, la dynamique de croissance, de motilité et de colonisation de cellules soumises à différentes conditions expérimentales. [Acquisition systems connected with thermoregulated incubators make possible long-term observation of 2D and 3D in vitro cultures of cancer cells. Processing of microscopic image sequences allows storing and extraction of large data sets. This aims to take out relevant information on growth and death rates, division duration, motility and colonization rate from cells in different experimental conditions.]
Analyse d'images et de données en anatomie pathologique [Image and data analysis in pathology]
Ce projet a pour objectif le développement de méthodes de standardisation, de calibration et d'extraction automatique de caractéristiques appliquées aux images de coloration immunohistochimique. La quantification d'immunomarquages via des techniques d'analyse d'images permet la caractérisation d'expression d'antigènes révélés par immunohistochimie (IHC) sur des coupes de tissus normaux ou pathologiques. Contrairement à d'autres techniques biochimiques, l'IHC préserve l'aspect morphologique du tissu analysé et permet une localisation précise des expressions, évitant les problèmes causés par l'hétérogénéité des tissus analysés. Il s'agit d'une approche prometteuse pour l'identification de biomarqueurs à des fins diagnostiques, pronostiques et/ou thérapeutiques. Ce projet est mené en étroite collaboration avec le service d'anatomie pathologique de l'hôpital Erasme (Pr. I. Salmon). [This project aims to develop standardization, calibration and automatic feature extraction methods from immunohistochemical images. The quantification of immunostaining by means of digital image analysis allows the characterization of protein expression revealed by immunohistochemistry on normal or pathological tissue slices. In contrast to other methods of evaluation of protein expression, this approach enables morphological controls and detailed tissue and cell localization to be carried out, avoiding the problems due to cell and tissue heterogeneity. This constitutes a promising approach for the identification of biomarkers usefull for diagnostic, prognostic and/or therapeutic purposes.This project is carried out in close collaboration with the Pathology Department of the Erasme Hospital (Pr. I. Salmon).]
Extraction de nouveaux descripteurs de marquages immunohistochimiques par analyse d'images [Extraction of new immunostain descriptors by means of image analysis]
Dévelopement d'outils d'analyse d'images pour l'extraction de nouveaux descripteurs dans le but de décrire la topologie des immunomarquages (organisation et distribution spatiale) ainsi que la colocalisation de plusieurs marquages réalisés sur des coupes sériées. [Development of image analysis tools for extracting new features characterizing immunostain topology (i.e. spatial distribution and organization) as well as immunostain colocalization on serial slides. ]
Recherche de nouveaux biomarqueurs dans les gliomes [Identification of new glioma biomarkers]
Caractérisation de l'expression des membres majeurs de la famille des galectines et du systèmes des IGF par immunohistochimique et analyse d'images sur de grandes series de gliomes et corrélation aux données cliniques. [Assessing the expression of the major components of the galectin family and the IGF system on large series of human glioma samples and correlating them with the clinical data]
Implications des galectines 1 et 3 dans l'angiogenèse des lymphomes [Involvement of galectin-1 and -3 in lymphoma angiogenesis]
Analyse de l'expression des galectines 1 et 3 ainsi que des acteurs d'angiogenèses dans les lymphomes dans le but d'évaluer leurs valeurs diagnostique et pronostique. [Analysis of galectin-1 and -3 expression in lymphomas as well as angiogenesis actors in lymphomas aiming to evaluate their diagnostic and prognostic values.]
Recherche de nouveaux biomarqueurs dans le cancer du colon [Identification of new biomarkers in colonic cancers]
Analyse de la valeur pronostique d'acteurs impliqués dans la réponse immune dans les cancers colorectaux. [Analysis of prognostic value of actors involved in immune tumor response in colorectal cancer]

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publications

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Decaestecker C (1991) "Description Contrasting in Incremental Concept Formation", in Machine Learning, EWSL-91, Y.Kodratoff (ed.), Lecture Notes in Artificial Intelligence 482, Springer-Verlag.
Decaestecker C (1993) "NNP: a neural net classifier using prototypes", Proc. IEEE International Conference on Neural Networks, San Fransisco, 28 March - 1 April 1993, pp 822-O - 824.
Decaestecker C and Van de Merckt T (1994), "Cognitive and Semantic interpretation of a NN classifier using prototypes", Proc. 1994 World Congress on Neural Networks, San Diego, USA.
Decaestecker C and Van de Merckt T (1994), "How to "secure" the decisions of a NN classifier", Proc. 1994 IEEE Inter. Conf. on Neural Networks, Orlando, USA, pp 263-268.
Van de Merckt T and Decaestecker C (1995), "Multiple-Knowledge Representation in Concept Learning", in Lavrac N. and Wrobel S. (Eds), Machine Learning: ECML-95 (Proc. European Conf. on Machine Learning, 1995), Lecture Notes in Artificial Intelligence 914, Springer Verlag, Berlin, Heidelberg, New York, 200 - 217.
Decaestecker C and Saerens M (1995), "Comparisons of different RBF networks for pattern classification", Proc. of ICANN'95 (Int. Conf. on Artificial Neural Networks), Paris, October 95.
Decaestecker C (1993) "Apprentissage et outils statistiques en classification conceptuelle incrementale", Revue d'Intelligence Artificielle (Hermes, Paris), Vol. 7, 1, pp 33-71.
Decaestecker C, Salmon I, Camby I, Dewitte O, Pasteels JL, Brotchi J, Van Ham P, Kiss R (1995), "Identification of high- versus lower-risk clinical subgroups in a group of adult patients with supratentorial anaplastic astrocytomas", Journal of Neuropathology and Experimental Neurology 54: 371-384.
Decaestecker C, Camby I, Salmon I, Brotchi J, Pasteels JL, Kiss R, Van Ham P (1995), "The combined use of the decision tree technique and the computer-assisted microscope analysis of feulgen-stained nuclei as an aid for astrocytic tumor aggressiveness characterization", International Journal of Oncology 7: 183-189.
Decaestecker C, Remmelink M, Camby I, Salmon I, Goldschmidt D, Van Ham P, Pasteels JL, Kiss R (1995), "The combination of a decision tree technique with the computer-assisted microscope analysis of feulgen-stained nuclei to assess aggressiveness in lipomatous and smooth muscle tumors", Anticancer Research. 15:1311-1318.
Decaestecker C, van Velthoven R., Petein M, Janssen T, Salmon I, Pasteels JL, Van Ham P, Schulman C, / The use of the decision tree technique and the image cytometry to characterize aggressiveness in World Health Organisation (WHO) grade II superficial transitional cell carcinomas of the bladder / Journal of Pathology 178: 274-283
Decaestecker C, Remmelink M, Salmon I, Camby I, Goldschmidt D, Petein M, Van Ham Ph, Pasteels JL, Ki / Methodological aspects of using Decision Trees to characterize leiomyomatous tumors / Cytometry 24: 83-92
Decaestecker C / Finding Prototypes for Nearest Neighbour Classification by means of Gradient Descent and Deterministic Annealing / Pattern Recognition 30(2). 281-288
Decaestecker C, Petein M, van Velthoven R, Janssen T, Raviv G, Pasteels JL, Schulman C, Van Ham P, K / The computer-assisted microscope analysis of feulgen-stained nuclei linked to a supervised learning algorithm as an aid to prognosis assessment in invasive transitional bladder cell carcinomas / Analytical Cellular Pathology 10: 263-280
Decaestecker C, Salmon I, DeWitte O, Camby I, Van Ham Ph, Pasteels JL, Brotchi J, Kiss R. / Nearest-neighbour method of classification for the identification of aggressive versus non-aggressive low-grade astrocytic tumors by means of image-cytometry-generated variables / Journal of Neurosurgery 86: 532-537
Decaestecker C, Lopes M-B, Gordower L, Camby I, Cras P, Martin J-J, Kiss R, VandenBerg S, Salmon I / Quantitative chromatin pattern description in Feulgen-stained nuclei as a diagnostic tool to characterise the oligodendroglial and astroglial components in mixed oligoatrocytomas. / Journal of Neuropathology and Experimental Neurology 56: 391-402.
Decaestecker C, Camby I, Remmelink M, Nagy N, Petein M, Pasteels J-L, Van Ham P, Salmon I, Kiss R / Decision Tree Induction: a useful tool for assisted diagnosis and prognosis in tumor pathology. / Laboratory Investigation 76 (6): 799-808.
Decaestecker C, Camby I, Nagy N, Brotchi J, Kiss R, Salmon I / Improving morphology-based malignancy grading schemes in astrocytic tumors by means of computer-assisted techniques / Brain Pathology 8:29-38
Decaestecker C, Camby I, Gordower L, Dewitte O, Cras P, Martin JJ, Pasteels JL, Van Ham P, Brotchi J / Characterization of astroglial versus oligodendroglial phenotypes in glioblastomas by means of quantitative morphonuclear variables generated by computer-assisted microscopy / J Neuropathol Exp Neuro 57(8):791-802

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theses

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Decaestecker, C., ''Apprentissage en Classification Conceptuelle Incrementale'', Dir. Prof. J. Janssen, Faculte des Sciences, Centre d'Analyse de Donnees et de Processus Stochastiques, ULB, Bruxelles, 1991
Decaestecker, Christine ''Apprentissage en Classification Conceptuelle Incrémentale'', 1991
Decaestecker, C. ''Développements méthodologiques pour la classification de données réelles. Application à l'aide au diagnostic et au pronostic de tumeurs gliales'', 1997
Decaestecker, C ''Développements Méthodologiques pour la Classification de Données Réelles. Applications à l'Aide au Diagnostic et Pronostic de Tumeurs Gliales'', Dir. Prof. A. Danguy, Faculté des Sciences (Unité de Morphologie Fonctionnelle) et Faculté de Médecine (Laboratoire d'Histologie), ULB, Bruxelles, 1997

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disciplines et mots clés déclarés

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Anatomopathologie Biologie cellulaire Cancérologie Informatique générale Informatique médicale Ingénierie biomédicale Intelligence artificielle Sciences biomédicales en général Techniques d'imagerie et traitement d'images
aide au diagnostic analyse d'image analyse de données analyse de scène anatomopathologie angiogenèse apprentissage automatique biomarqueur cancérologie cible thérapeutique colonisation cellulaire contrôle de qualité culture cellulaire in vitro division cellulaire extraction de descripteurs galectines galectines gliome igf (insulin growth factors) immunohistochimie lymphome migration cellulaire pronostic reconnaissance de forme reconstruction 3D réponse tumorale immune segmentation suivi, poursuite system digestif

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